程序：
(1)违法线索发现--(2)线索核查与违法行为制止--(3)立案--(4)调查取证--(5)案情--析与调查报告起草--(6)案件审理--(7)作出处理决定(行政处罚决定或者行政处理决定)--(8)执行--(9)结案--(10)立卷归档
涉及需要移送公安、检察、监察、任免机关追究刑事责任、行政纪律责任的，应当依照有关规定移送。
时限：作出行政处罚决定的期限一般为立案之日起六十日内。案情复杂不能在规定期限内作出行政处罚决定的，报本级国土资源主管部门负责人批准，可以适当延长，但延长期限原则上不超过三十日，案情特别复杂的除外。
案件查处过程中的鉴定、听证、委托其他部门的认定、公告、邮递在途等时间不计入前款规定的期限；涉嫌犯罪移送的，等待公安机关、检察机关作出决定的时间，不计入前款规定的期限。
依据:
(1)《中华人民共和国土地管理法》
(2)《中华人民共和国城市房地产管理法》
(3)《中华人民共和国城乡规划法》
(4)《中华人民共和国矿产资源法》
(5)《中华人民共和国行政处罚法》
(6)《中华人民共和国行政强制法》
(7)《中华人民共和国行政许可法》
(8)《中华人民共和国行政复议法》
(9)《中华人民共和国行政诉讼法》
(10)《中华人民共和国民法通则》
(11)《中华人民共和国物权法》
(12)《中华人民共和国刑法》
(13)《中华人民共和国民事诉讼法》
(14)《中华人民共和国城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》(国务院令第55号)
(15)《矿产资源补偿费征收管理规定》(国务院令第150号)
(16)《中华人民共和国矿产资源法实施细则》(国务院令第152号)
(17)《济南市城乡规划条例》
(18)《济南市城乡规划条例》
(19)《山东省地质环境保护条例》
(20)《城市房地产开发经营管理条例》(国务院令第248号)
(21)《中华人民共和国土地管理法实施条例》(国务院令第256号)
(22)《基本农田保护条例》(国务院令第257号)
(23)《行政执法机关移送涉嫌犯罪案件的规定》(国务院令第310号)
(24)《地质灾害防治条例》(国务院令第394号)
(25)《国务院关于预防煤矿生产安全事故的特别规定》(国务院令第446号)
(26)《中华人民共和国行政复议法实施条例》(国务院令第499号)
(27)《土地调查条例》(国务院令第518号)
(28)《土地复垦条例》(国务院令第592号)
(29)《国务院关于坚决制止占用基本农田进行植树等行为的紧急通知》(国发明电〔2004〕1号)
(30)《国务院关于深化改革严格土地管理的决定》(国发〔2004〕28号)
(31)《国务院关于全面整顿和规范矿产资源开发秩序的通知》(国发〔2005〕28号)
(32)《国务院关于加强土地调控有关问题的通知》(国发〔2006〕31号)
(33)《国务院办公厅关于规范国有土地使用权出让收支管理的通知》(国办发〔2006〕100号)
(34)《国务院办公厅关于严格执行有关农村集体建设用地法律和政策的通知》(国办发〔2007〕71号)
(35)《国务院关于促进节约集约用地的通知》(国发〔2008〕3号)
(36)《关于实行党政领导干部问责的暂行规定》(中办发〔2009〕25号)
(37)《中共中央办公厅 国务院办公厅转发国务院法制办等部门<关于加强行政执法与刑事司法衔接工作的意见>的通知》(中办发〔2011〕8号)
(38)《建设用地审查报批管理办法》(国土资源部令第3号)
(39)《划拨用地目录》(国土资源部令第9号)
(40)《违反土地管理规定行为处分办法》(监察部、人力资源和社会保障部、国土资源部令第15号)
(41)《协议出让国有土地使用权规定》(国土资源部令第21号)
(42)《国土资源听证规定》(国土资源部令第22号)
(43)《土地利用年度计划管理办法》(国土资源部令第37号)
(44)《招标拍卖挂牌出让国有建设用地使用权规定》(国土资源部令第39号)
(45)《土地登记办法》(国土资源部令第40号)
(46)《建设项目用地预审管理办法》(国土资源部令第42号)
(47)《土地利用总体规划编制审查办法》(国土资源部令第43号)
(48)《山东省基本农田保护条例》
(49)《土地调查条例实施办法》(国土资源部令第45号)
(50)《闲置土地处置办法》(国土资源部令第53号)
(51)《土地复垦条例实施办法》(国土资源部令第56号)
(52)《国土资源行政处罚办法》(国土资源部令第60号)
(53)《节约集约利用土地规定》(国土资源部令第61号)
(54)《国土资源部关于加强地热、矿泉水勘查、开采管理的通知》(国土资发〔2000〕209号)
(55)《国土资源部关于印发矿业权出让转让管理暂行规定》的通知(国土资发〔2000〕309号)
(56)《国土资源部关于印发<国土资源执法监察错案责任追究制度>的通知》(国土资发〔2000〕431号)
(57)《国土资源部关于印发<国土资源违法案件会审制度>等三项制度的通知》(国土资发〔2001〕372号)
(58)《国土资源部关于印发〈市(地)县(市)级国土资源主管部门矿产资源监督管理暂行办法〉的通知》(国土资发〔2003〕17号)
(59)《监察部 国土资源部关于监察机关和国土资源部门在查处土地违法违纪案件中加强协作配合的通知》(监发〔2005〕6号)
(60)《
(61)《国土资源部关于印发<招标拍卖挂牌出让国有土地使用权规范>(试行)和<协议出让国有土地使用权规范>(试行)的通知》(国土资发〔2006〕114号)
(62)《国土资源部 监察部关于落实工业用地招标拍卖挂牌出让制度有关问题的通知》(国土资发〔2007〕78号)
(63)《国土资源部关于建立健全土地执法监管长效机制的通知》(国土资发〔2008〕173号)
(64)《国土资源部最高人民检察院 公安部关于国土资源主管部门移送涉嫌国土资源犯罪案件的若干意见》(国土资发〔2008〕203号)
(65)《最高人民法院 最高人民检察院 公安部 国土资源部关于在查处国土资源违法犯罪工作中加强协作配合的若干意见》(国土资发〔2008〕204号)
(66)《监察部 人力资源和社会保障部 国土资源部关于适用〈违反土地管理规定行为处分办法〉第三条有关问题的通知》(监发〔2009〕5号)
(67)《国土资源部 监察部关于进一步落实工业用地出让制度的通知》(国土资发〔2009〕101号)
(68)《国土资源部关于印发<国土资源执法监察巡查工作规范>(试行)的通知》(国土资发〔2009〕127号)
(69)《国土资源部关于进一步规范探矿权管理有关问题的通知》(国土资发〔2009〕200号)
(70)《国土资源部办公厅关于印发<关于进一步加强和规范对违反国土资源管理法律法规行为报告工作的意见>的通知》(国土资厅发〔2010〕58号)
(71)《国土资源部关于进一步加强对违反国土资源管理法律法规行为发现、制止、报告和查处工作的通知》(国土资电发〔2010〕78号)
(72)《国土资源部 住房和城乡建设部关于进一步加强房地产用地和建设管理调控的通知》(国土资发〔2010〕151号)
(73)《国土资源部 农业部关于完善设施农用地管理有关问题的通知》(国土资发〔2010〕155号)
(74)《国土资源部关于印发城乡建设用地增减挂钩试点和农村土地整治有关问题的处理意见的通知》(国土资发〔2011〕80号)
(75)《国土资源部 国家发展和改革委员会关于发布实施<限制用地项目目录(2012年本)>和<禁止用地项目目录(2012年本)>的通知》(国土资发〔2012〕98号)
(76)《国土资源部关于严格执行土地使用标准大力促进节约集约用地的通知》(国土资发〔2012〕132号)
(77) 《国土资源部关于强化管控落实最严格耕地保护制度的通知》(国土资发〔2014〕18号)
(78)《最高人民法院关于执行〈中华人民共和国行政诉讼法〉若干问题的解释》(法释〔2000〕8号)
(79)《关于审理破坏土地资源刑事案件具体应用法律若干问题的解释》(法释〔2000〕14号)
(80)《最高人民法院关于行政诉讼证据若干问题的规定》(法释〔2002〕21号)
(81)《关于审理非法采矿、破坏性采矿刑事案件具体应用法律若干问题的解释》(法释〔2003〕9号)
(82)《最高人民法院关于审理破坏林地资源刑事案件具体应用法律若干问题的解释》(法释〔2005〕15号)
(83)《最高人民法院关于审理破坏草原资源刑事案件应用法律若干问题的解释》(法释〔2012〕15号)
(84)《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉若干问题的意见》(法发(1992)22号)
(85)最高人民检察院等10部门《关于在查办渎职案件中加强协调配合建立案件移送制度的意见》(高检会〔1999〕3号)
(86)《最高人民法院 国土资源部 建设部关于依法规范人民法院执行和国土资源房地产管理部门协助执行若干问题的通知》(法发〔2004〕5号)
(87)《最高人民检察院 国土资源部关于印发〈关于人民检察院与国土资源主管部门在查处和预防渎职等职务犯罪工作中协作配合的若干规定(暂行)〉的通知》(高检会〔2007〕7号)
(88)《最高人民检察院 公安部关于印发〈最高人民检察院 公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定(一)〉的通知》(公通字〔2008〕36号)
(89)《最高人民检察院 公安部关于印发〈最高人民检察院 公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定(二) 〉的通知》(公通字〔2010〕23号)
(90)《山东省实施<中华人民共和国土地管理法>办法》
(91)《山东省实施<中华人民共和国矿产资源法>办法》
(92)《山东省土地登记条例》